EMS超過1000元被扣是指進出口貨物在海關申報和審批過程中，因為價值超過了一定標準而被扣留或退回的情況。根據中國海關的規定，進口貨物的單票貨值超過人民幣1000元時，需要進行正式的報關手續，并繳納相應的稅費。下面我們來詳細介紹一下EMS超過1000元被扣的相關情況。

需要明確的是，EMS超過1000元被扣的具體原因會因貨物種類、目的地等因素而有所不同。例如，如果貨物存在質量問題或涉嫌侵權等，可能會被要求繳納相關的罰款或稅費；如果貨物無法提供相關的證明材料或清關手續不齊全，也可能會被要求繳納相應的費用。

需要注意的是，EMS超過1000元被扣的程序比較繁瑣和復雜，需要遵循相關的法律法規和規定。在進行EMS超過1000元被扣時，需要提前了解清楚相關的服務時間和聯系方式，以便做好溝通和協調。

第三，需要注意的是，EMS超過1000元被扣可能會對客戶的信譽度和聲譽產生一定的影響。在進行EMS超過1000元被扣時，客戶需要盡量避免出現不必要的問題和糾紛，及時與物流公司或清關代理公司進行溝通和協商。

需要提醒的是，盡管EMS超過1000元被扣可能會給客戶帶來一定的不便和損失，但它也是一種保護客戶利益和服務品質的重要措施。如果您需要進行國際貿易或貨運業務，建議您選擇一家信譽度高、服務質量好的物流公司作為合作伙伴，并及時咨詢專業的EMS清關機構，以便更好地完成相關手續和文件的處理。同時，也建議客戶在進行貨物運輸時注意貨物的價值和清關手續的準備，以避免出現不必要的問題和糾紛。